Gondolin était la cité de Turgon, sur la colline d'Amon Gwareth. En 53 du Premier Âge, Turgon, initialement installé en Nevrast, découvrit avec l'aide d'Ulmo une vallée secrète, la Vallée de Tumladen, à l’intérieur des barrières naturelles de l'Echoriath, qui lui donnèrent une protection maximale. En plus de ces barrières, la dépression faisait l'objet de la vigilance des Aigles qui repoussaient les espions et serviteurs de Morgoth. Turgon décida alors d'y faire construire sa nouvelle cité, Gondolin, à l'image de Tirion. A partir de l'année 64, les Noldor, probablement aidés de certains des Sindar de Nevrast, construisirent secrètement la ville aux blanches murailles et aux hautes tours de marbre, dont la plus élevée était la Tour du Roi, aux nombreuses places ornées de fontaines, dont la plus fameuse était la Place de la Fontaine, aux larges rues richement arborées, notamment de nombreuses espèces, tels le Mallorn, et aux deux marchés. Devant le palais royal furent notamment installés Belthil et Glingal, les copies de Telperion et de Laurelin réalisées par Turgon. L’enceinte de la ville était percée d'au moins deux portes, la Porte Ouest et la Porte Nord, reliées à la vallée par des escaliers sculptés à même le roc d'Amon Gwareth. Les travaux s'achevèrent en 116, année pendant laquelle, dans le plus grand secret et aidés par Ulmo, Turgon et son peuple quittèrent définitivement le Nevrast et Vinyamar, et s'installèrent à Gondolin.

Durant quatre siècles, Gondolin prospéra sous le règne de Turgon. La ville fut néanmoins privée de la présence d'Aredhel, sœur du Roi, lorsque celle-ci la quitta en 316. Elle y revint toutefois en 400, accompagnée de son fils Maeglin et pourchassée par Eöl, et finalement tuée accidentellement par ce dernier qui fut condamné à être jeté du haut des murailles dans le Caragdûr.

Dissimulée comme elle l'était, la cité reçut peu de visiteurs au cours de son histoire. Cependant, en 458, Huor et Húrin, résidant un temps en Brethil, furent coupés des leurs lors d'une attaque des Orques, et s'égarèrent en Dimbar et dans les Crissaegrim. Thorondor les aperçut et leur vint en aide avec ses Aigles, les emmenant en Gondolin. Ils furent ainsi les premiers Hommes à voir la ville fortifiée, où ils gagnèrent la confiance et les faveurs de Turgon. Néanmoins, désirant rejoindre leur peuple, ils finirent par obtenir la permission de quitter Ondolindë, promettant d'en garder le secret.

Mis au courant des mouvements de troupes de l'Union de Maedhros par Thorondor, Turgon décida de rejoindre la coalition. Ce fut ainsi qu'en 472, les armées de Gondolin firent leur sortie, complètement inattendues des autres Eldar, suscitant de grandes clameurs parmi les troupes de Fingon. Mais Turgon et ses Gondothlim n'échappèrent que de peu au désastre de Nirnaeth Arnoediad, couverts par Huor, Húrin et leurs Hommes, et regagnèrent Gondolin, ne désirant plus se mêler aux affaires du Beleriand.

Mais un autre visiteur allait encore parvenir à Ondolindë : en 496, Tuor, messager d'Ulmo, guidé par Voronwë, trouva l'entrée secrète de la Vallée de Tumladen. Passant par les Sept Portes de Gondolin, il arriva alors à la cité et délivra à Turgon le message d'Ulmo, le mettant en garde et lui enjoignant de quitter Gondolin. Turgon, trop attaché à sa cité, et appuyé par Maeglin, rejeta ce message. Tuor s'établit néanmoins en Gondolin, et, en 502, il épousa Idril, dont il eut un fils en 503, Eärendil. Il constitua également la dernière des Douze Maisons de Gondolin.

Menée par un mauvais pressentiment, Idril fit alors creuser un passage souterrain, partant de leur demeure vers le nord. Ce passage allait se révéler de la plus extrême importance : Maeglin, lors d'une de ses randonnées dans l'Echoriath, fut capturé par des Orques patrouillant dans la région, que Morgoth avait à l'œil depuis que Húrin, relâché, s'y était attardé et avait invoqué Turgon en vain. Manipulé par Morgoth, Maeglin finit par trahir la position de la cité, en échange d'Idril. Ce fut ainsi qu'en 510 les forces de Morgoth, composées d'Orques, de Dragons, et de Balrogs, attaquèrent la cité par le nord. Les combats furent terribles, mais malheureusement Gondolin fut investie, son peuple décimé et Turgon tué. Des survivants, menés par Tuor et Idril, réussirent néanmoins à s'échapper par le passage qu'Idril avait fait aménager, menant les fugitifs jusqu'à Cirith Thoronath.