Dol Guldur était une tour servant de forteresse qui fut créée aux alentours de l'an 1000 du Troisième Âge sur la colline d'Amon Lanc par Sauron, revenu en Terre du Milieu mais dont l'identité n'était pas encore révélée. Située tout au sud de Vertbois-le-Grand, les ténèbres tombèrent sur la forêt en 1050, et ce n'est qu'en 1100 qu'on remarqua un sombre pouvoir dans Dol Guldur.
Elle fut dès l’an 2060 la résidence de Sauron pour préparer son grand retour. En 2063, les sages virent là un signe de sa réapparition, Gandalf s’y rendit donc en personne, ce qui fit fuir l'Ennemi des Peuples libres, encore faible, et qui installa la Paix Vigilante, avec un profil bas des Nazgûl.

Des années plus tard, en 2460, la paix prit fin et Sauron revint plus en force. A cette époque, en 2463, se mit donc en place le Conseil Blanc. Commença alors la lente remontée de Sauron, avec un repeuplement des Monts Brumeux par les Orques, et l’éclatement de différentes guerres plus ou moins liées. Le Seigneur des Ténèbres envoya également de sombres créatures dans Vertbois-le-Grand, comme des Araignées, ce qui valut à la forêt le nom de Forêt Noire, et ce pour des centaines d’années. Même les cavaliers d’Eorl allant au Gondor pour la Bataille des Champs du Celebrant furent oppressés par la tour lors de leur rapide passage vers le sud.

Thráin II, poursuivi par les espions de Sauron, y fut enfermé en 2845. On lui prit le dernier des Sept Anneaux des Nains. Gandalf intervint une nouvelle fois, la même année ; il pénétra déguisé dans la tour, et avant que le Nain meurt, il donna à l’Istar la clef d’Erebor ainsi qu’une carte.
En 2851, Gandalf poussa le Conseil Blanc à attaquer Dol Guldur, mais Saroumane, chef de l’ordre (contre l’avis de Galadriel qui aurait bien vu Gandalf à sa place), eut le dessus. A l’époque déjà tourné vers la recherche de l’Anneau Unique pour son seul compte, il pensait qu’en laissant l’ennemi tranquille, il arrêterait de chercher l’objet, et que lui-même pourrait alors l’avoir à sa guise.
Sauron continua donc son travail, faisant fouiller dès l’an 2939 les abords des Champs d’Iris, malgré une surveillance accrue, venant même de la Lórien par l’élévation d’un gigantesque Flet.

En 2941, pendant la Quête d’Erebor, Gandalf quitta Thorin et Compagnie pour se rendre à la dernière réunion du Conseil Blanc : il convainquit tout le monde d’attaquer une bonne fois pour toute Dol Guldur et d’en chasser Sauron, alors appelé le « Nécromancien ». Saroumane consentit à l’attaque car Sauron était alors très actif, et aurait pu retrouver l’Anneau Unique avant lui (il était en fait dans les mains même de Bilbo).
Sauron fut donc chassé, mais cela ne le dérangea pas vraiment, ayant déjà fait ses plans de guerre ; il retourna au Mordor et entreprit la reconstruction de Barad-dûr : il se déclara ouvertement dès l’an 2951, envoyant quand même entre-temps trois de ses Nazgûl garder Dol Guldur. Elle dégagea alors de nombreuses fumées de mauvais augure, et fut le siège d’allers et retours des différents serviteurs de Sauron de là au Mordor.

Malgré la destruction de l'Anneau Unique le 25 mars 3019, la guerre faisait toujours rage plus au nord entre Orques et Peuples libres.
La nouvelle de la chute de Barad-dûr ayant fait s'effondrer le moral des troupes assiégeant la Lórien, Celeborn et Galadriel en profitèrent pour traverser l'Anduin en bateau à la tête de leurs troupes. Dol Guldur fut prise facilement le 28 mars 3019 et le pouvoir de Galadriel détruisit la forteresse et purifia cette partie de la Forêt Noire qui fut renommée Eryn Lasgalen, le Bois des Vertes Feuilles, par Celeborn et Thranduil. Tous deux se rencontrèrent le 6 avril pour décider du sort du territoire : la partie septentrionale fut accordée à Thranduil, la centrale donnée aux Beornides et aux Hommes des Bois, et la plus méridionale à Celeborn qui fonda la Lórien orientale.